Acupunctuur werkt via het zenuwstelsel. Een naald in een acupunctuurpunt in de huid activeert namelijk de zenuwbanen die druk registreren. Dit wordt dan doorgegeven aan het zenuwweefsel in het ruggemerg.

In het ruggemerg komt het acupunctuurprik van de huid op één plaats samen met informatie vanuit corresponderende spieren, botten en organen. Door deze organisatievorm kan er "spraakverwarring" optreden over de herkomst van de informatie.

Acupunctuur maakt hiervan gebruik als route om de activiteiten in het ruggemerg bij te sturen. Dit heeft dan indirect (via hersenen) of direct (via ruggemerg) effect op o.a. organen, spieren, hormonen etc. in het lichaam.